Oma eksistentsi esimestel aastatel püüdis riik saada tunnustust Jugoslaavia ainsa õigusjärglasena, kuid teised endised liiduvabariigid olid neile väidetele vastu. Ühinenud Rahvaste Organisatsioon lükkas Jugoslaavia kaasamise taotluse tagasi. Lõpuks, pärast Slobodan Milosevici tagandamist föderatsiooni presidendi koh alt 2000. aastal, loobus riik nendest püüdlustest ja nõustus Badinteri arbitraažikomitee arvamusega ühise pärimise kohta. Ta taotles uuesti ÜRO liikmestaatust 27. oktoobril ja võeti vastu 1. novembril 2000.
Manuaal
Jugoslaavia Liitvabariiki juhtis algselt Slobodan Milosevic Serbia presidendina (1989–1997) ja seejärel Jugoslaavia presidendina (1997–2000). Milosevic pani ametisse ja sundis tagandama mitu föderaalpresidenti (näiteks Dobrica Cosic) ja peaministrit (nt Milan Panic). Montenegro valitsus, kes algselt toetas palav alt Miloševićit, hakkas aga tasapisidistantseeruvad tema poliitikast. See viis režiimivahetuseni 1996. aastal, kui tema endine liitlane Milo Đukanović muutis oma poliitikat, sai Montenegro valitseva partei juhiks ja vallandas seejärel Montenegro endise juhi Momir Bulatovići, kes jäi lojaalseks Miloševići valitsusele. Kuna sellest ajast määrati Bulatović Belgradi kesksetele ametikohtadele (föderaalpeaministrina), jätkas Đukanović Montenegro valitsemist ja eraldas selle veelgi Serbiast. Seega 1996.–2006 Montenegro ja Serbia olid nominaalselt üks riik. Kõigi võimalike poliitiliste, majanduslike ja sotsiaalsete segmentide juhtimine viidi läbi kohalikul tasandil, Serbia puhul Belgradis ja Montenegro puhul Podgoricas.
Serbia ja Montenegro Liit
Lõdva liidu või konföderatsioonina olid Serbia ja Montenegro ühendatud ainult teatud valdkondades, nagu kaitse. Kaks moodustavat riiki toimisid eraldi kogu liiduvabariigi eksisteerimise aja ja jätkasid tegutsemist eraldiseisva majanduspoliitika raames, samuti eraldi valuutade kasutamisega (euro oli Montenegros ainus seaduslik maksevahend). 21. mail 2006 toimus Montenegro iseseisvuse referendum ja iseseisvuse poolt hääletas 55,5% valijatest. Endise Jugoslaavia viimased jäänused, 88 aastat pärast selle loomist, said lõpu Montenegro ametliku iseseisvusdeklaratsiooniga 3. juunil 2006 ja Serbia ametliku iseseisvusdeklaratsiooniga.juunini. Pärast lagunemist sai Serbiast liidu õigusjärglane ja taasiseseisvunud Montenegro taotles uuesti rahvusvahelistesse organisatsioonidesse kuulumist.
Katastroofi tagajärjed
Pärast Jugoslaavia kokkuvarisemist 1990. aastatel nõustusid Jugoslaavia riigi säilitamisega ainult Serbia ja Montenegro vabariigid ning 1992. aastal võtsid nad vastu uue Jugoslaavia jaoks uue põhiseaduse. Pärast kommunismi kokkuvarisemist Ida-Euroopas järgnes uus riik demokraatlike muutuste lainele. Sellega loobuti kommunistlikust sümboolikast: riigilipult eemaldati punane täht ja kommunistlik vapp asendati valge kahepäine kotkaga, mille sees olid Serbia ja Montenegro vapid. Uus riik lõi ka ühe inimese presidendiameti, mis algselt määrati ametisse Serbia ja Montenegro vabariikide nõusolekul kuni 1997. aastani, misjärel valiti president demokraatlikult.
Jugoslaavia Liitvabariigi loomine
Jugoslaavia ja selle institutsioonide kokkuvarisemisega aastatel 1991–1992 kerkis üles küsimus kahe lagunevasse föderatsiooni jäänud vabariigi – Serbia, Montenegro – ühtsusest; samuti serblaste enamusega territooriumid Horvaatias ja Bosnias, mis soovisid ühtseks jääda. 1991. aastal leppisid lord Carringtoni juhitud diplomaatiliste läbirääkimiste tulemusena kuue juhiga kõik vabariigid, välja arvatud Serbia, kokku, et Jugoslaavia lagunes ja iga selle autonoomne osa peaks saama iseseisvaks riigiks. Serbia valitsus oli üllatunud ja nördinud Montenegro otsusest lõpetadaJugoslaavia, kuna Bulatovitši valitsus oli varem tihed alt seotud Milosevici valitsusega Serbias. Jugoslaavia kokkuvarisemine algas 1991. aastal, kui Sloveenia, Horvaatia ja Makedoonia kuulutasid välja iseseisvuse. Seejärel moodustati Jugoslaavia Liitvabariik.
Kolmas Jugoslaavia
26. detsembril 1991 leppisid Serbia, Montenegro ja Serbia mässuliste territooriumid Horvaatias kokku, et moodustavad uue "kolmanda Jugoslaavia". 1991. aastal tehti jõupingutusi ka sotsialistlik-revolutsioonilise Bosnia ja Hertsegoviina kaasamiseks föderatsiooni, kus on käimas läbirääkimised Milosevici, Bosnia Serbia Demokraatliku Partei ja Bosnia ühendamise toetaja, Bosnia asepresidendi Adil Zulfikarpasici vahel. Zulfikarpašić uskus, et Bosniale on Serbia ja Montenegroga ühinemisest kasu, mistõttu toetas ta liitu, mis tagaks serblaste ja bosnialaste ühtsuse. Jugoslaavia Liitvabariigi lipp ei erinenud millegi poolest oma eelkäijariigist.
Milosevic jätkas Zulfikarpasiciga läbirääkimisi Bosnia kaasamise üle uude Jugoslaaviasse. Püüdlused liita kogu Bosnia uude Jugoslaaviasse lõppesid aga 1991. aasta lõpuks, kui Izetbegović kavatses korraldada iseseisvusreferendumi, samal ajal kui Bosnia serblased ja Bosnia horvaadid moodustasid autonoomsed territooriumid.
Tüli vennasrahvaste vahel
Alates 1996. aastast on esimesed avalikud märgid poliitilisest vastuolustosa Montenegro ja Serbia juhtkonnast. 1998. aastaks, kui Montenegro peaminister Milo Đukanović tõusis võimuvõitluses esiplaanile Montenegro presidendi Momir Bulatovićiga, järgis vabariik teistsugust majanduspoliitikat, võttes valuutaks Saksa marga. 1999. aasta sügisel, pärast Kosovo sõda ja NATO pommitamiskampaaniat, koostas Đukanović (kes nüüdseks oli kindl alt Montenegros võimul, kuna Bulatović oli täielikult tagandatud) dokumendi kavandi pealkirjaga Platforma za redefiniciju odnosa Crne Gorei Srbije ("Föderaalplatvorm"). Jugoslaavia Vabariik"), kutsudes üles tegema suuri muudatusi halduskohustuste jaotuses Jugoslaavia FR-s, kuigi ametlikult näeb Montenegrot endiselt Serbiaga ühisriigina. Milosevic ei vastanud platvormile, pidades seda põhiseadusega vastuolus olevaks.
Tõusev pinge
Liitriigi poliitilised suhted muutusid üha pingelisemaks, eriti mõlema vabariigi tipppoliitiliste, kriminaalsete ja riigiäritegelaste (Zeljko "Arkan" Rozhnatovic, Pavle Bulatovic, Chika Petrovic ja Goran) mõrvamise laine taustal. Žugić) ja ka kaks katset opositsioonipoliitiku Vuk Draškovići elu vastu. 2000. aasta oktoobriks oli Milosevic Serbias võimu kaotanud. Vastupidiselt ootustele ei olnud Đukanovićani reaktsioon võimuvahetusele Belgradis mitte oma "Platvormis" sätestatud päevakorra edasisurumises, vaid äkitselt täieliku iseseisvuse poole püüdlemises.selle protsessi käigus täielikult ära visates. Montenegro järgnevad valitsused järgisid iseseisvusmeelset poliitikat ja poliitilised pinged Serbiaga kasvasid vaatamata poliitilistele muutustele Belgradis. Kõik need kired olid Jugoslaavia Liitvabariigi loomise ajaloo loomulik tulemus.
Konföderatsiooni asutamine
2002. aastal sõlmisid Serbia ja Montenegro koostöö jätkamise uue kokkuleppe, mis muu hulgas tõotas Jugoslaavia lõppu. Mõlemad riigid kuulusid varem Jugoslaavia Liitvabariigi koosseisu. 4. veebruaril 2003 lõi Jugoslaavia föderaalassamblee vabariikide liidu ehk konföderatsiooni – Serbia ja Montenegro liit. Jõuti kokkuleppele uue põhiseadusliku harta osas, mis annaks aluse riigi valitsemiseks.
Montenegro iseseisvus
Pühapäeval, 21. mail 2006 hääletasid montenegrolased iseseisvusreferendumil. Iseseisvumist toetas 55,5%. Selline "jah"-häälte arv oli Jugoslaavia laialisaatmiseks vajalik. Osalusprotsent oli 86,3% ja 99,73% enam kui 477 000 antud häälest olid kehtivad.
Montenegro (juunis 2006) ja Serbia (5. juuni) iseseisvusdeklaratsioon lõpetas Jugoslaavia konföderatsiooni ja seega ka liiduvabariigi viimased jäänused.
Jugoslaavia Liitvabariigi majandusareng
Riik sai majanduse kokkuvarisemise ja ebaefektiivse juhtimise tõttu oluliselt kannatada ningsamuti pikendatud majandussanktsioonide perioodi. 1990. aastate alguses kannatas Jugoslaavia dinaari hüperinflatsiooni all Jugoslaavia Liitvabariik. 1990. aastate keskpaigaks oli Jugoslaavia Liit inflatsioonist üle saanud. Kosovo sõjast Jugoslaavia infrastruktuurile ja tööstusele tekitatud edasine kahju jättis majanduse vaid poole suuremaks kui 1990. aastal. Pärast endise Jugoslaavia föderaalpresidendi Slobodan Milosevici tagandamist 2000. aasta oktoobris rakendas Serbia Demokraatliku Opositsiooni (DOS) koalitsioonivalitsus stabiliseerimismeetmeid ja alustas agressiivse turureformi kava. Pärast Rahvusvahelise Valuutafondi liikmeks naasmist 2000. aasta detsembris jätkas Jugoslaavia taasintegreerumist ülejäänud maailmaga, liitudes Maailmapanga ning Euroopa Rekonstruktsiooni- ja Arengupangaga.
Väiksem Montenegro Vabariik eraldas Milosevici ajastul oma majanduse föderaalsest kontrollist ja Serbiast. Seejärel olid kahel vabariigil eraldi keskpangad, samas kui Montenegro hakkas kasutama erinevaid valuutasid: esm alt võttis ta kasutusele Deutschi kaubamärgi ja jätkas selle kasutamist, kuni see lagunes ja asendati euroga. Serbia jätkas Jugoslaavia dinaari kasutamist, nimetades selle ümber Serbia dinaariks.
Jugoslaavia Liitvabariigi poliitiliste suhete keerukus, erastamise aeglane edenemine ja Euroopa majanduse stagnatsioon on majandusele kahju teinud. Kokkulepped IMF-iga, eriti nõuded finantsdistsipliinile, olid poliitika kujundamisel olulised. Tõsine tööpuudus olivõtmetähtsusega poliitiline ja majanduslik küsimus. Korruptsioon on suureks probleemiks ka suure musta turu ja ametliku majandusega seotud kuritegeliku seotuse korral.