Kombinatiivne varieeruvus on kõigi elusorganismide liigisisese mitmekesisuse peamine põhjus. Kuid selline geneetiline modifikatsioon viib ainult juba olemasolevate tunnuste uue kombinatsiooni moodustumiseni. Ja kombineeritud varieeruvus ja selle mehhanismid ei põhjusta kunagi põhimõtteliselt erineva geenikombinatsiooni ilmnemist. Täiesti uute omaduste tekkimine erinevate geenivariatsioonide tõttu on võimalik ainult liigisiseste mutatsioonimuutuste korral.
Kombinatiivse varieeruvuse määrab paljunemisprotsessi iseloom. Seda tüüpi geenimodifikatsiooni iseloomustab uute genotüüpide tekkimine äsja moodustunud geenikombinatsioonidel. Kombinatiivne varieeruvus avaldub juba sugurakkude (sugurakkude) moodustumise faasis. Lisaks on igas sellises rakus esindatud ainult üks kromosoom igast homoloogsest paarist. On iseloomulik, etkromosoomid satuvad sugurakku juhuslikult, mille tulemusena võivad ühes organismis olevad sugurakud geenide komplekti poolest üsna palju varieeruda. Samal ajal ei täheldata päriliku teabe otseses kandjas keemilisi muutusi.
Seega on kombineeritud varieeruvus tingitud kromosoomikomplektis juba olemasolevate geenide erinevatest rekombinatsioonidest. Seda tüüpi geenide modifikatsioone ei seostata ka geenide ja kromosoomistruktuuride muutustega. Kombinatiivse varieeruvuse allikad saavad olla ainult rakkude jagunemise (meioosi) vähenemise ja viljastumise ajal toimuvad protsessid.
Päriliku materjali erinevate rekombinatsioonide elementaarset (väikseimat) ühikut, mis põhjustab uute geenikombinatsioonide teket, nimetatakse rekoniks. Iga selline recon vastab kahele nukleotiidile (nukleiinhapete ehitusplokkidele) kaheahelalistes DNA molekulides ja ühele nukleotiidile, kui tegemist on viiruste nukleiinhappe üheahelalise struktuuriga. Recon ei jagune ristumise ajal (vahetusprotsess paaris homoloogsete kromosoomide vahel konjugatsiooni ajal) ja edastatakse kõigil juhtudel tervikuna.
Eukarüootsete rakkude kombineeritud varieerumine toimub kolmel viisil:
- Geeni rekombinatsioon ristumise protsessis, mille tulemuseks on kromosoomide moodustumine uute alleelide kombinatsioonidega.
- Sõltumatu juhuslik lahkneminekromosoomid meiootilise jagunemise esimese etapi anafaasis, mille tulemusena omandavad kõik sugurakud oma geneetilised omadused.
- Juhuslikud sugurakkude kohtumised viljastamise ajal.
Seega omandab iga sugurakkude ühinemisel moodustunud sügootrakk nende kolme kombineeritud varieeruvuse mehhanismi kaudu täiesti ainulaadse geneetilise informatsiooni komplekti. Just need pärilikud modifikatsioonid selgitavad tohutut liigisisest mitmekesisust. Geneetiline rekombinatsioon on ülim alt oluline mis tahes bioloogilise liigi evolutsiooni jaoks, kuna see loob arvuk alt erinevaid genotüüpe. See teebki iga populatsiooni heterogeenseks. Oma individuaalsete tunnustega organismide ilmumine määrab loodusliku valiku kõrge efektiivsuse, andes sellele võimaluse jätta ainult kõige edukam pärilike tunnuste kombinatsioon. Tänu uute organismide kaasamisele paljunemisprotsessi paraneb geneetiline ülesehitus pidev alt.